Seit der Bewerbung um den Titel „Stadt der Wissenschaft 2006“ hat Magdeburg die Zusammenarbeit mit den Hochschulen und den wissenschaftlichen Einrichtungen intensiviert. Mit dem „Team Wissenschaft“ gibt es innerhalb der Stadtverwaltung im Büro des Oberbürgermeisters feste Strukturen und Ansprechpartner für die Hochschulen, Forschungs – und Wissenschaftseinrichtungen der Stadt.

Hier wird die Zusammenarbeit zwischen den Einrichtungen koordiniert. So bereitet das Team Wissenschaft unter anderem gemeinsam mit den Hochschulen und Instituten die jährlich stattfindende Lange Nacht der Wissenschaft oder das RoboCup Meisterschaften vor.

Magdeburg ist gemeinsam mit der Otto-von-Guericke-Universität und der Hochschule Magdeburg-Stendal Mitglied im europäischen Städtenetzwerk EUniverCities. Im Netzwerk haben sich mittelgroße europäische Universitätsstädte mit dem Ziel zusammengeschlossen, die Kooperationen zwischen Städten und Hochschulen zu verbessern.

Das Team Wissenschaft entwickelt gemeinsam mit der AG Wissenschaft, bestehend aus Vertretern aller ortsansässigen Forschungseinrichtungen, Projekte und Initiativen zur Stärkung des Wissenschaftsstandortes Magdeburg.